阜阳港有界首、太和、颍上、临泉、阜阳等14个作业区,设计年港口吞吐能力367万吨。主要有阜阳港界首作业区、阜阳港太和作业区、阜阳港颍上作业区。共有生产性码头泊位109个,其中300吨级泊位4个;港区岸线长度4.81公里,生产用仓库2748平方米,生产用堆场77969平方米;铁路专用线2条总长7957米,其中装卸线长度1600米;全市辖区内拥有18家水运企业、3170艘运输船舶、118万吨运力。可以承接各种货船代理,豫、皖直达江、浙、沪的铁、公、水联运业务和直达闽、粤、琼的江海河联运业务。